De missie van NWO is het bevorderen van wetenschappelijk onderzoek van wereldklasse met wetenschappelijke en maatschappelijke impact. NWO benadert dit vanuit haar visie om een ​​verbindende factor te zijn en laat zich leiden door haar kernwaarden: baanbrekend, betrokken, betrouwbaar en verbindend. Als wetenschapsfinancier faciliteert NWO excellent, nieuwsgierigheidsgedreven disciplinair, interdisciplinair en multidisciplinair onderzoek. NWO beheert tevens negen nationale onderzoeksinstituten via NWO-I, een onafhankelijke stichting. Energieonderzoek wordt uitgevoerd bij de NWO-instituten DIFFER, AMOLF, CWI en NIOZ waarbij DIFFER zich specifiek richt op energie.